AutoDock分子对接工具安装包下载安装配置教程

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AutoDock是一个用于分子对接的开源软件,它可以预测生物大分子(如蛋白质和核酸)和小分子(如底物、抑制剂、药物等)之间的相互作用。AutoDock通过模拟分子间的相互作用,可以预测出小分子在生物大分子中的结合位置、结合能量以及结合构象等。AutoDock软件在药物设计、生物信息学、结构生物学等领域具有广泛的应用。它可以帮助研究人员理解生物分子之间的相互作用机制,为药物设计提供理论指导,加速药物研发的进程。

软件下载


安装教程


1.选中下载好的安装包,右键选择“解压到当前文件夹”

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2.双击运行“python-2.7.11 amd64”

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3.勾选“Install for all users”,点击“Next”

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4.默认安装位置,点击“Next”;

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5.正在安装

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6.安装完成,点击“Finish”;

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7.开始右键选择“系统”

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8.点击“高级系统设置”;

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9.点击“高级-环境变量”;

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10.点击系统变量中的Path,点击编辑

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11.点击新建,分别输入“C:\Python27”和“C:\Python27\Scripts”

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12.按下win+R键,输入“cmd”,点击“确定”;

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13.输入“python –version”,显示结果,安装成功!

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安装AutoDock

1.回安装文件夹,选中“autodocksuite-4.2.6.i86Windows”,右键选择以管理员身份运行

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2.修改安装路径,安装路径中不要出现中文,点击“Install”;

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3.安装完成,点击“Close”。

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安装MGLtools

1.返回安装文件夹,选中“mgltools_win32_1.5.7_Setup”,右键选择以管理员身份运行

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2.点击“Next”

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3.勾选同意协议,点击“Yes”

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4.默认安装路径不要更改,点击“Next”

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5.软件正在安装,请耐心等待

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6.出现弹窗,点击“OK”

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7.取消勾选第一条,勾选第二三条,点击“Finish”

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8.这时桌面会出现四个快捷方式

PMV:主要用于分子可视化和分析,是一个通用的分子查看器

AutoDockTools (ADT):用于分子对接准备和分析,特别适用于 AutoDock

Raccoon:用于高通量虚拟筛选,适合大规模对接任务

Vision:用于创建和管理复杂的计算工作流,整合多个工具的功能

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配置AutoDock

1.在D盘新建一个文件夹“Autodock-setting”;

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2.找到安装Autodock的路径,复制这两个程序到D盘新建的Autodock-setting文件夹中,找到MGLTools的安装路径,复制“adt”到D盘新建的Autodock-setting文件夹中

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3.双击桌面上的软件图标

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4.点击“File-preferences-set”

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5.将D:\Autodock-setting,路径粘贴到startup directory,点击“make default”

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6.安装结束

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